絮凝剂主要分为有机絮凝剂、无机絮凝剂和生物絮凝剂。这三种絮凝剂分为无机盐和酸、碱、盐等。通过蛋白质和动物胶的有机絮凝，实现了整个废水中有机、无机和生物物质的合理絮凝，提高了废水处理工艺效果。
絮凝的关键是絮凝剂的选择。絮凝剂可以聚集和连接溶液中的悬浮颗粒，形成粗絮状聚集体或团块。无机高分子絮凝剂能提供大量复杂的离子，并能强烈吸附胶体颗粒，从而通过粘附、桥接和交联促进胶体聚集。一些天然高分子有机物，如含更多羧基的多糖和含更多磷酸基团的淀粉，具有絮凝特性。通过化学方法在大分子中引入反应基团可以改善这种性能，降低污染和加工成本。
当酸碱度突然下降时，好氧区和厌氧区的磷浓度急剧上升。酸碱度下降得越大，释放量就越大。这表明，由酸碱度降低引起的磷释放不是磷积累细菌对酸碱度变化的生理生化反应，而是纯化学的“酸溶解”效应。此外，由酸碱度降低引起的厌氧释放量越大，需氧磷吸收能力越低。这表明由酸碱度降低引起的释放是破坏性的和无效的。当酸碱度增加时，磷会有轻微的吸收。(3)溶解氧每毫克分子氧消耗1.14毫克容易生物降解的化学需氧量(COD)，抑制聚磷生物的生长，难以达到预期的除磷效果。
另一方面，盐氮的存在将被气单胞菌用作反硝化的电子受体，从而影响其以发酵中间体为电子受体的发酵产酸，从而抑制PAO的磷释放和吸收能力以及PHB合成能力。每毫克X-酸盐氮可消耗2.86毫克容易生物降解的化学需氧量，因此厌氧释磷受到抑制，一般控制在1.5毫克/升以下。⑤污泥龄由于生物除磷系统主要通过排放剩余污泥来除磷，剩余污泥的量决定了系统的除磷效果，污泥龄的长短直接影响剩余污泥的排放量和污泥对磷的吸收。
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